浦本駅は、相対式ホーム2面2線をもつ高架駅である。分岐器や絶対信号機を持たないため、停留所に分類される。高架駅ではあるが築堤の上にホームはありその下にある駅舎から見ると高い位置である。ホームとの行き来は、下りホームについては改札を入ったところから階段とスロープが延びているほか、上りホームについては改札を入って左手に小さな道がありその道が線路の下を通ったのちスロープでホームにつながっている。ホームはいずれも高い位置にあるため、海から少し離れているにもかかわらず海が見える。
浦本駅からはトンネル区間になるが、かつての北陸本線が複線電化する前は、浦本駅から谷浜駅にかけて、目の前の山を迂回しながら海岸線ぎりぎりをはしっていた。
路線：えちごトキめき鉄道日本海ひすいライン
列車種別：普通直江津駅行き
車両：ET122形
天候：晴
No. 0109 5
鉄也の旅